Wykonujemy komputerowa analizę oraz projektowanie białek tj:
- przewidywanie struktury trzecio- i czwartorzędowej na podstawie sekwencji (homology modeling, threading, ab initio, metody własne)
- modelowanie funkcji (teoria elektrodyfuzji, dynamika molekularna i brownowska),
- modelowanie wpływu mutacji na strukturę i funkcję
- komputerowa walidacja modeli białek natywnych i syntetycznych
- komputerowe wsparcie projektowania białek
- analiza danych eksperymentalnych i projektowanie nanoporów
- tworzenie dedykowanych modeli statystycznych i heurystycznych (SVM, metody bayesowskie, probabilistyczne modele gramatyczne)
- rozwój i integracja dostępnych metod oraz oprogramowania typu open source
- wyszukiwanie, weryfikacja i łączenie publicznie dostępnych zbiorów danych i ontologii
- wsparcie techniczne dla użytkowników aplikacji open source